Axiom 蘋果基因分型陣列有48,139個(gè)蘋果屬 SNP。該陣列是與 Julius Kühn 研究所的 Peil 博士和其他國際合作伙伴合作設(shè)計(jì)的。該陣列使用一個(gè)先前進(jìn)行基因分型的不同品種組合以及一個(gè)野生蘋果屬種質(zhì)組合進(jìn)行設(shè)計(jì)。
該陣列的設(shè)計(jì)包括以下內(nèi)容:
? 向后兼容的一組 SNP(7,711個(gè)),這些 SNP 可在 Illumina Infinium 20K 陣列和 Applied Biosystems Axiom 480K 陣列上準(zhǔn)確、可靠地聚類
? 采用單倍型塊策略使每 125 kB 中一個(gè) 10 kB 窗口包含8個(gè) SNP,均勻覆蓋 HFTH1 全基因組序列
? 針對(duì)重要性狀的經(jīng)驗(yàn)證 SNP
? 專門針對(duì)蘋果屬山荊子、西府海棠、東方莢果蕨、八枝海棠、新疆野蘋果和歐洲野生蘋果的 SNP
? 用于檢測(cè) S 等位基因的一組 SNP
該陣列還具有 384HT 規(guī)格。
所需產(chǎn)品
GeneChip Command Console 軟件
GeneTitan 多通道儀器
Axiom Analysis Suite 軟件
Axiom 長格式導(dǎo)出工具 (AxLE)