數(shù)字PCR是可以實(shí)現(xiàn)分子定量的儀器，和PCR技術(shù)、熒光定量PCR（qPCR）技術(shù)相比，具有定量優(yōu)勢，和高通量測序（NGS）相比，又具有較高的靈活性，兼具成本把控優(yōu)勢。JN Medsys的數(shù)字PCR（Clarity TM）是一種新型的數(shù)字PCR，可實(shí)現(xiàn)分子的定量。不同于微滴式數(shù)字PCR，該儀器采用了8聯(lián)管管內(nèi)芯片設(shè)計(jì)，分區(qū)更穩(wěn)定，無需移液步驟，數(shù)據(jù)更準(zhǔn)確。每個上樣管內(nèi)部的高密度芯片擁有10000個分區(qū)，擁有高靈敏。具有優(yōu)勢：8聯(lián)管兼容市面上的普通PCR儀和試劑，降低實(shí)驗(yàn)成本；采用了封閉式系統(tǒng)，減小了污染；全自動分區(qū)，利用表面張力、虹吸原理上樣，分區(qū)速度小于1分鐘；分析速度在同類儀器中突出，96個反應(yīng)時間僅為4小時。十分適合低豐度分子的高靈敏度、定量分析。
1.8聯(lián)管管內(nèi)芯片設(shè)計(jì)技術(shù)
檢測時不依賴傳統(tǒng)的Ct值即可實(shí)現(xiàn)真正意義上的定量，從而提供了比實(shí)時熒光定量PCR更精確的基因差異表達(dá)研究，尤其對于那些靶基因表達(dá)差異微小的情況，比如等位基因的不平衡表達(dá)以及單細(xì)胞基因表達(dá)分析等；
2. 其他基因組學(xué)及表觀遺傳學(xué)相關(guān)研究
①拷貝數(shù)變異(CNV)研究：
通過8連管內(nèi)芯片上上萬個分區(qū)對樣本進(jìn)行處理及后續(xù)擴(kuò)增，擺脫Ct值的計(jì)算方法而直接獲取目標(biāo)基因的拷貝數(shù)，為拷貝數(shù)變異的研究提供了的檢測精度。還可進(jìn)行NGS文庫定量，成本低、通量高。
②稀有突變檢測：
對于稀有突變檢測，定量PCR、及NGS等方法都因受到背景DNA的干擾，使得檢測靈敏度及精確性都達(dá)不到精細(xì)定量的要求(如定量PCR檢測中Ct值大于33的情況下，其重復(fù)性就不是很高)， 而JNMedsys ClarityTM Digital PCR通過對樣本的上萬個分區(qū)處理，使得稀有突變從大量的背景DNA中分離出來，從而提高了檢測的靈敏度及重復(fù)性。
3. 醫(yī)學(xué)分子檢測
①精準(zhǔn)醫(yī)療（轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)）的應(yīng)用：
如肺癌等相關(guān)的EGFR、KARS、BRAF基因的SNP突變檢測、乳腺癌的HER2基因檢測等從而指導(dǎo)各種靶向藥物的選擇與用藥方案的調(diào)整。
②疾病超早期分子檢測：
隨著研究的展開，很多實(shí)驗(yàn)室發(fā)現(xiàn)基于ddPCR對于諸如血液、痰液、尿液等體液樣品中核酸水平的疾病相關(guān)標(biāo)記分子（DNA、mtDNA、miRNA等）的檢測，其發(fā)現(xiàn)疾病的時間遠(yuǎn)早于影像學(xué)或其他蛋白類標(biāo)記物的相關(guān)檢測，而且結(jié)果的靈敏度更高，穩(wěn)定性更好，與傳統(tǒng)的核酸檢測方法相比，大大提前了疾病發(fā)現(xiàn)的窗口期，更好地實(shí)現(xiàn)對疾病的早發(fā)現(xiàn)，早治療。
4 病原微生物的檢測（病毒、細(xì)菌等）
疾病預(yù)防控制中心、系統(tǒng)的實(shí)驗(yàn)室目前主要采用基于TaqMan探針法的定量PCR體系對病原微生物進(jìn)行核酸水平的檢測，而這些目前正在使用著的檢測體系可以無縫地轉(zhuǎn)移到JNMedsys ClarityTM Digital PCR上，從而滿足該類實(shí)驗(yàn)室對于檢測結(jié)果的要求：靈敏度更高、重復(fù)性更好、無需依賴標(biāo)準(zhǔn)曲線的定量結(jié)果，同時操作簡便。
5 轉(zhuǎn)基因食品或成分的檢測
目前在確定轉(zhuǎn)基因作物或成分的含量時采取定量PCR的標(biāo)準(zhǔn)曲線法，這種方法需要依賴于已知濃度的標(biāo)準(zhǔn)品(Certified Reference Materials Calibrants, CRMCs)。JNMedsys ClarityTM Digital PCR定量的方式可以解決這些標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)的定標(biāo)工作。
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