微波滅菌在中西藥生產中已有應用，上世紀八十年代初，有關研究單位曾做實驗：將含菌量高達350萬個大鹽水混懸液密封與1～2ml的安瓶中，繼3～5kw，2450MHZ的微波作用15秒以上，安瓶溫度接近110℃，細菌全部殺滅。金黃色葡萄球菌與詞此類同，枯草桿菌芽胞含量為6～8萬個/ML液溫應達140℃，保持20秒鐘，可全部殺滅細菌。
此外還對安痛定、維生素B1、維生素C、尿、慶大霉素、卡那霉素等注射液用微波滅菌除去溶液外，其余5分鐘，PH和主要成分含量都無明顯數(shù)據報道。微波滅菌與高壓蒸汽，滅菌對17種化學藥材定性的影響，證明對高壓蒸汽滅菌穩(wěn)定的藥物，使用微波滅菌也就變化，而對高壓蒸汽滅菌不穩(wěn)定的藥物，為維生素C，阿斯匹林等用微波滅菌則比較穩(wěn)定，其分解程度降低。又如含有2000～3000個真菌孢子的鹽水懸混液，在3～4KW微波功率作用下，液溫達到120℃以上，在20～25秒種，既可*滅菌。
中藥，尤其直接入藥的藥材，由于產于土垠。生于空氣中，在貯放環(huán)境中茗通風及衛(wèi)生條件不符合要求，也易造成昆蟲、細菌的繁殖，故在洗藥，常規(guī)干燥時，難以將生物及微生物或卵、螨等清除或殺滅。因而，此種藥材即使經粉碎、過篩后也難以符合中國藥典所規(guī)定的雜菌指標要求，必須對其進行滅菌處理。生草鳥、甘草、穿心蓮經微波加熱、烘箱和未經加熱的樣品，從成分含量測定的結果分析，生物堿、內脂、有機酸等對微波加熱較穩(wěn)定。經微波處理后，基本上沒有被破壞，一般滅菌時間為3～6分鐘。
總之，一般溫度在80℃，照射數(shù)分鐘或數(shù)十分鐘，丸劑就可以達到滅菌效果。如密丸照射數(shù)分鐘可殺死74%～89%細菌，水丸照射16～22分鐘，可殺滅94%～99%的細菌，飲片照射2～4分鐘可殺滅99%的細菌，其效果優(yōu)于干熱滅菌，而且熱轉換效率高，，節(jié)約能源、衛(wèi)生、符合GMP要求并可實現(xiàn)自動控制及連續(xù)化生產。若將微波滅菌用于抗骨質增生丸，采用196W的輸出功率，滅菌時間3分鐘，可將大部分細菌殺滅，而且丸劑保持外行不變，滅菌后的丸劑顯干燥。
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