PLS-DA/OPLS-DA二維圖:偏zuì |小二乘判別分析(PLS-DA)或正交偏zuì |小二乘判別分析(OPLS-DA)是一種有監(jiān)督的判別分析統(tǒng)計方法.該方法運用偏zuì |小二乘回歸建立代謝物表達(dá)量與樣品類別之間的關(guān)系模型,來實現(xiàn)對樣品類別的預(yù)測.

詳細(xì)介紹

PLS-DA/OPLS-DA二維圖-詳情介紹：

不同于主成分分析（PCA）法，Partial Least Squares Discrimination Analysis（PLS-DA）或Orthogonal PLS-DA（OPLS-DA）是一種有監(jiān)督的判別分析統(tǒng)計方法。該方法運用PLS-DA建立代謝物表達(dá)量與樣品類別之間的關(guān)系模型，來實現(xiàn)對樣品類別的預(yù)測。分別建立兩兩分組比較的PLS-DA模型（圖1）或OPLS-DA模型（圖2），模型得到的參數(shù)評價會以表格形式提供。其中R^2X和R^2Y分別表示所建模型對X和Y矩陣的解釋率，Q2標(biāo)示模型的預(yù)測能力，理論上R^2、Q^2數(shù)值越接近1說明模型越好，越低說明模型的擬合準(zhǔn)確性越差，通常情況下，R^2、Q^2高于0.5（50%）較好，高于0.4即可接受，且兩者差值不應(yīng)過大。臨床樣本由于個tǐ |差異大，不可控，尤其大樣本時，R^2、Q^2大小為0.2左右亦可。圖3則是對PLS-DA模型（c）的檢驗，直線的斜率大，Q^2的截距為X，說明PLS-DA模型沒有過擬合。同時通過計算變量投影重要度（Variable Importance for the Projection, VIP）來衡量各代謝物的表達(dá)模式對各組樣本分類判別的影響強(qiáng)度和解釋能力，從而輔助標(biāo)志代謝物的篩選（通常以VIP值>1.0作為篩選標(biāo)準(zhǔn)）（圖4）。

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圖1 假手術(shù)組和模型組的PLS-DA 得分圖

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圖2 假手術(shù)組和模型組的OPLS-DA模型

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圖 3 PLS-DA模型的排列檢驗圖

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圖 4 假手術(shù)組和模型組的PLS-DA 模型載荷圖

注：紅框所圈的點為VIP＞1的代謝產(chǎn)物

PLS-DA/OPLS-DA二維圖-詳情介紹

百泰派克生物科技-生物藥物表征，生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

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