賽默飛ABI Ion GeneStudio S5基因測(cè)序儀

• 測(cè)序反應(yīng)僅需2.5-4小時(shí)即可完成

• 使用Ion Xpress Plus片段文庫(kù)試劑盒時(shí)， 基因組DNA與擴(kuò)增文庫(kù)制備僅需2.5小時(shí)； 使用Ion AmpliSeq靶向富集技術(shù)時(shí)， 僅需3.5個(gè)小時(shí)
• 在Ion Chef系統(tǒng)上， 自動(dòng)對(duì)兩塊Ion S5芯片進(jìn)行模板制備與芯片上樣
• 在Ion S5 Torrent服務(wù)器上進(jìn)行數(shù)據(jù)分析， 數(shù)小時(shí)之內(nèi)完成變異檢測(cè)報(bào)告

性能

描述

簡(jiǎn)單快速的基因組DNA
文庫(kù)制備

Ion Xpress Plus片段文庫(kù)試劑盒為用戶(hù)提供了用于基因組和擴(kuò)增子文庫(kù)制備的快速而高度均一的酶切片段化方法

• 單人即可在約2小時(shí)內(nèi)完成插入片段100-至400-堿基的基因組DNA文庫(kù)的制備
• 酶切片段化無(wú)需物理剪切， 并兼容自動(dòng)化操作系統(tǒng)(Library Builder系統(tǒng)和自動(dòng)化系統(tǒng))
• 僅需100 ng DNA樣品即可生成無(wú)需擴(kuò)增的測(cè)序文庫(kù)
• Ion Torrent芯片上可對(duì)多達(dá)96個(gè)標(biāo)簽樣品進(jìn)行混合處理， 這種高度多重化的擴(kuò)增子測(cè)序操作，可以實(shí)現(xiàn)單個(gè)樣品中數(shù)以千計(jì)的基因靶標(biāo)的檢測(cè)

簡(jiǎn)單、 快速、 靈活的
靶向測(cè)序

Ion AmpliSeq靶向篩選技術(shù)適用于對(duì)DNA與RNA靶標(biāo)進(jìn)行低起始樣品量、高度多重化、 支持混合樣品的靈活測(cè)序需求

• 結(jié)合多重PCR技術(shù)， 僅需10 ng FFPE DNA或RNA起始樣品量
• 利用 AmpliSeq Designer工具， 對(duì)任何基因組都能簡(jiǎn)單快速地開(kāi)展定制設(shè)計(jì)
• 通過(guò)自動(dòng)化引物設(shè)計(jì)實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)單快速的靶向篩選， 僅需數(shù)分鐘
• 對(duì)要求快速處理的樣本， 僅在兩個(gè)8小時(shí)工作日內(nèi)即可完成從基因組DNA樣品輸入到變異檢測(cè)結(jié)果的整個(gè)工作流程， 大幅提升實(shí)驗(yàn)室效率
• 憑借單管12到6144重?cái)U(kuò)增子與96個(gè)標(biāo)簽序列技術(shù)， 實(shí)現(xiàn)一次操作處理96份樣品
• 簡(jiǎn)單的PCR工作流程， 無(wú)需額外設(shè)備
• 靈活兼容定制試劑盒與便捷的即用型試劑盒，
• Ion Library Equalizer試劑盒無(wú)需稀釋、 定量或任何附加設(shè)備即可實(shí)現(xiàn)對(duì)Ion Torrent DNA文庫(kù)的均一化處理
• 針對(duì)超過(guò)20000條基因進(jìn)行基因表達(dá)檢測(cè)

構(gòu)建mate-pair文庫(kù)并
開(kāi)展相關(guān)測(cè)序

Ion TrueMate Plus文庫(kù)試劑盒與高效DN段測(cè)序聯(lián)合使用， 為用戶(hù)提供簡(jiǎn)單、 快速、 精確的基因組組裝方法

• Ion TrueMate技術(shù)適用于高效的mate-pair片段構(gòu)建操作， 同時(shí)實(shí)現(xiàn)小的序列偏性和極低的冗余度
• 僅需2–10 μg DNA起始樣品量

針對(duì)混合微生物群落開(kāi)
展快速、 全面和廣泛的
研究分析

無(wú)需培養(yǎng)即可快速鑒定多細(xì)菌研究樣品

• 可直接使用樣品中的原始材料， 無(wú)需培養(yǎng)、 混合培養(yǎng)或純培養(yǎng)操作
• 針對(duì)多個(gè)微生物變異區(qū)設(shè)計(jì)的引物組， 幫助用戶(hù)在種屬水平對(duì)各類(lèi)細(xì)菌進(jìn)行精確的鑒定
• 兼具靈活性， 引物組分成2管， 單管也可開(kāi)展獨(dú)立分析
• 可使用標(biāo)簽序列對(duì)引物進(jìn)行標(biāo)記

快速、 簡(jiǎn)單的基因表達(dá)
分析

Ion AmpliSeq轉(zhuǎn)錄組人類(lèi)基因表達(dá)檢測(cè)試劑盒可檢測(cè)超過(guò)20000條RefSeq收錄的轉(zhuǎn)錄本， 兼容FFPE樣品的快速工作流程僅需低至10 ng RNA起始量

• 約1小時(shí)手動(dòng)操作完成文庫(kù)制備， 在兩天內(nèi)即可完成從RNA樣品到獲得基因表達(dá)水平信息的完整流程
• 實(shí)現(xiàn)低成本的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序， 而無(wú)需等待數(shù)周以收集樣品
• 利用現(xiàn)有的下游微陣列或新一代測(cè)序分析技術(shù)， 實(shí)現(xiàn)簡(jiǎn)易， 自動(dòng)化的基因差異表達(dá)數(shù)據(jù)分析

快速、 靈活的小RNA
與全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序

Ion總RNA測(cè)序v2試劑盒為用戶(hù)提供了制備cDNA文庫(kù)的快速方法， 適用于全轉(zhuǎn)錄組或小RNA文庫(kù)的鏈特異性測(cè)序。

• 小RNA或全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序所需的文庫(kù)制備通?？稍?-6小時(shí)之內(nèi)完成
• 以低至100 ng的poly(A) RNA構(gòu)建文庫(kù)， 或以200 ng去除rRNA的總RNA樣品構(gòu)建全轉(zhuǎn)錄組文庫(kù)，或以1-100 ng小RNA富集產(chǎn)物構(gòu)建小RNA文庫(kù)
• 保存鏈相關(guān)信息， 以便在相對(duì)于染色體鏈的轉(zhuǎn)錄方向上進(jìn)行數(shù)據(jù)的比對(duì)
• 自動(dòng)化操作， 兼容基于微球的純化操作
• 通過(guò)Invitrogen Ambion RiboMinus真核生物v2試劑盒實(shí)現(xiàn)高效的rRNA清除

高質(zhì)量外顯子組測(cè)序

Ion AmpliSeq外顯子組RDY試劑盒采用了簡(jiǎn)單的PCR富集技術(shù)、 檢測(cè)通量靈活， 包含完整的生物信息學(xué)分析

• 通過(guò)簡(jiǎn)單、 快速的特異性PCR技術(shù)， 不到60分鐘手工操作完成全外顯子組富集
• 低單外顯子組檢測(cè)成本， 可一次檢測(cè)1-2個(gè)外顯子組， 或每周40小時(shí)的工作時(shí)間內(nèi)檢測(cè)10個(gè)外顯子組， 靈活性
• 整合的軟件與分析流程提供關(guān)于已注釋變異的集中列表
• 高效富集， 靶向數(shù)據(jù)和覆蓋均一度均超過(guò)90%， 大部分測(cè)序深度達(dá)到10x和20x
• 僅需50 ng DNA和2天時(shí)間， 即可完成從DNA樣品到獲得注釋變異的完整流程

適用于所有應(yīng)用的靈
活、 便捷的樣品標(biāo)記

樣品序列標(biāo)簽試劑盒與軟件提升測(cè)序的樣品通量

• Ion Xpress序列標(biāo)簽接頭1-96 試劑盒適用于同步分析多重樣品
• Ion Xpress RNA-Seq 序列標(biāo)簽1-16 試劑盒可同步分析多重RNA樣品
• Torrent Suite軟件可同步處理多達(dá)384序列標(biāo)簽

性能

描述

無(wú)人值守的全自動(dòng)化模
板擴(kuò)增和芯片加載

Ion Chef系統(tǒng)可自動(dòng)完成文庫(kù)在Ion Sphere微粒上的模板制備， 并自動(dòng)將模板加載到Ion S5芯片

• 高度自動(dòng)化， 低程度人工干預(yù)， 僅需15分鐘手工操作
• 單次運(yùn)行可同時(shí)處理兩塊Ion S5芯片， 完成從文庫(kù)到半導(dǎo)體芯片加載
• 每人每天可完成4份乃至更多文庫(kù)(每份文庫(kù)384樣品序列標(biāo)記)的模板制備工作
• 適合各種操作水平的高通量實(shí)驗(yàn)室或用戶(hù)

Ion OneTouch 2系統(tǒng)可自動(dòng)完成文庫(kù)在Ion Sphere微粒上的模板制備，
并通過(guò)模塊化設(shè)計(jì)實(shí)現(xiàn)樣品的高通量處理

• 整合各種操作水平的高通量實(shí)驗(yàn)室或用戶(hù)
• 可與Ion OneTouch 2模板試劑盒配合使用， 在Ion Sphere微粒上穩(wěn)定生成單克隆擴(kuò)增模板， 并加載到Ion S5芯片
• 單人每天可完成4份乃至更多文庫(kù)(每份文庫(kù)多384樣品序列標(biāo)記)的模板制備工作
• 可添加Ion OneTouch 2系統(tǒng)， 進(jìn)一步提高Ion S5系統(tǒng)的樣品處理通量
• 針對(duì)低通量實(shí)驗(yàn)室， 這是具性?xún)r(jià)比的自動(dòng)化模板制備選項(xiàng)

性能

描述

單日完成測(cè)序與數(shù)據(jù)分析

Ion S5測(cè)序儀與Ion S5 Torrent服務(wù)器(預(yù)裝Torrent Suite軟件)組合， 為研
究人員提供了從堿基識(shí)別到變異檢測(cè)的完整解決方案

• Ion S5 Torrent服務(wù)器與Torrent Suite軟件能夠?qū)x器數(shù)據(jù)快速轉(zhuǎn)換為堿基識(shí)別比對(duì)結(jié)果， 并提供行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)格式的數(shù)據(jù)輸出
• Ion RNA-Seq分析插件： 分析全轉(zhuǎn)錄組RNA測(cè)序的輸出結(jié)果。 本插件能夠生成讀值比對(duì)指標(biāo)、質(zhì)控(QC)指標(biāo)、 基因與轉(zhuǎn)錄本計(jì)數(shù)、 樣品校正熱圖與散點(diǎn)圖， 以及基因與轉(zhuǎn)錄本水平的熱圖
• Ion AmpliSeq RNA插件： 為針對(duì)Ion AmpliSeq轉(zhuǎn)錄組試劑盒的測(cè)序輸出結(jié)果進(jìn)行分析而設(shè)計(jì)。本插件能夠生成讀值比對(duì)指標(biāo)、 質(zhì)控指標(biāo)、 讀值分布散點(diǎn)圖、 樣品校正熱度散點(diǎn)圖、 兼容Excel軟件的報(bào)告以及差異表達(dá)列表
• Torrent變異識(shí)別插件： 識(shí)別純合或雜合的SNP， 以直觀的插件報(bào)告顯示結(jié)果，并能夠識(shí)別頻率低至5%的單堿基變異
• 自動(dòng)鑒定擴(kuò)增子重測(cè)序結(jié)果中的突變， 并通過(guò)廣泛使用的基因組瀏覽器(Integrative GenomicsViewer， 可從broadinstitute.org/igv/home獲取)實(shí)現(xiàn)可視化
• 支持樣品序列標(biāo)記(固定與定制標(biāo)簽)
– 每個(gè)標(biāo)簽都可實(shí)現(xiàn)FASTQ分析和質(zhì)量檢測(cè)
– 多達(dá)384個(gè)定制序列標(biāo)簽

簡(jiǎn)易整合的三級(jí)分析工具

超越Ion S5 Torrent服務(wù)器的直觀數(shù)據(jù)分析工具

• 用于注釋基因組變異的Ion Reporter軟件
• 用戶(hù)可在Torrent瀏覽器插件商店(Torrent Browser Plugin Store)下載其他Torrent Suite軟件插件，適用于基因組測(cè)序分析、 靶向測(cè)序分析、 變異分析與注釋、 微生物測(cè)序分析、 轉(zhuǎn)接第三方生物信息學(xué)軟件包等
• 支持用戶(hù)/創(chuàng)建自己的專(zhuān)屬分析插件
• 提供第三方商業(yè)化分析工具， 適用于廣泛的Ion Torrent半導(dǎo)體測(cè)序應(yīng)用
• 通過(guò)選用四百五十萬(wàn)多個(gè)即用型Applied Biosystems TaqMan探針或設(shè)計(jì)定制化TaqMan探針， 對(duì)Ion Torrent半導(dǎo)體測(cè)序所發(fā)現(xiàn)的變異進(jìn)行確認(rèn)； TaqMan探針能夠?yàn)镾NP基因型鑒定工作提供出色的靈敏度和特異性確認(rèn)， 如需提高靈敏度以檢測(cè)低頻突變或體細(xì)胞突變時(shí)， 可通過(guò)標(biāo)準(zhǔn)或數(shù)字化PCR儀開(kāi)展分析