一.系統(tǒng)配置及主要技術(shù)參數(shù):
1凝膠專用透射反射多功能掃描儀
用于染色凝膠Biox X光膠片的定量和光密度分析.
線性動能范圍寬可達(dá)0-3.4OD
輸出8位載12位的數(shù)據(jù)文件.
具有透射,反射彩色,灰度掃描方式
采用TWAIN標(biāo)準(zhǔn)驅(qū)動方式
掃描方式:三線CCD
光學(xué)解析度:3200 dpi × 6400 dpi
解析度:65535 dpi(PC),32767dpi(Mac)
掃描范圍:8.5” × 14”/216mm × 355mm
透射稿尺寸::8” × 10”/203mm × 254mm
光學(xué)濃度:3.9p
色彩數(shù): 色彩24/42 灰接8/14 黑白
2驅(qū)動軟件:BOT專業(yè)智能掃描控制系統(tǒng)
3.▲定量凝膠分析軟件(Gel-Pro/AABI):美國進(jìn)口分析軟件(其中1D部分帶有漢化包,并可做2D電泳分析及聚類分析)
4.品牌電腦,主流配置
二.BOT-26凝膠影像分析軟件說明
BOT-26電泳光密度掃描分析系統(tǒng)主要用于基因組和蛋白質(zhì)組學(xué)研究領(lǐng)域,可分析蛋白電泳、酪蛋白、乳清蛋白、血清蛋白、血紅蛋白、血清脂蛋白、體液蛋白等電泳樣品,生物芯片、微板、印記雜交膜、動植物壓縮標(biāo)本等
1D主導(dǎo)程序 (一維凝膠電泳)
預(yù)處理:解析鈍化和增強(qiáng)弱帶
1D、PCR、TCL 分析簡易參照泳帶
試驗(yàn)泳帶,圖形,用戶自編文件報(bào)告和菜單
單泳帶或多泳帶定量報(bào)告和注釋
凝膠上所有泳帶的報(bào)告
用戶自定義報(bào)告定量、辨別、命名及14項(xiàng)功能任意選擇
2D(二維)凝膠的定量辨別
沿著或圍繞PCR泳帶掃描
影像定量:橢圓形、圓形、矩形及隨意形狀定量
2D主導(dǎo)程序 (二維凝膠電泳)
2D:定量和識別(分子量和等電點(diǎn)),所有或部分
2D、PCR、原位雜交、 DNA多影像的比較
全部或部分斑點(diǎn)的比較和對比表試驗(yàn):參比(T/R)及%變化(T-R/R)
1D增強(qiáng)程序增補(bǔ)
任意兩條泳帶的定量和比較,樣品/參照/比率和每條泳帶T-R/R變化比
1D與其它的對比,圖形疊加,識別圖形和對比表
多圖形的排列,圖形和列表對比,%均化
所有樣品的平均圖形
圖形識別:試驗(yàn)樣品與對照品的圖形識別
動態(tài)視覺與定量比較,將一泳帶與旁邊的泳帶疊加并儲存加以分析
基因表達(dá)和2D動態(tài)對比,疊加全部或部分2D、排列和儲存用于定量對比
2D 增強(qiáng)程序增補(bǔ)
影像圖的圖形比較柱狀圖:紅色(樣品),綠色(參照物)…兩者相等
扣除圖
凝膠的規(guī)律性疊加 和動態(tài)比較
PCR,RFLP
基因圖譜,分子量和總量判讀,基因配對,聚類和百分相似比分析
PCR和RFLP:總量及分子量判讀
單基因或蛋白與其它的百分相似比,基因指紋圖譜,也可聚類分析